С 8 декабря 2011 г. Библиотека ГБОУ ВПО НГМУ Минздрава России при технической поддержке отдела информатизации начали создание электронной библиотеки НГМУ (Приказ №763 от 08.12.2011 "О создании электронной библиотеки НГМУ").
С 25 января 2012 г. начал формироваться фонд электронной библиотеки (Приказ №26 от 25.01.2012 "Об утверждении регламента формирования и использования фонда электронной библиотеки НГМУ") вручную, а с 11 июля 2013 г. (Приказ №340 от 11.07.2013 "О размещении документов для передачи в электронную библиотеку") с использованием средств автоматизации.
24 июля 2012 г. (Приказ №359 от 24.07.2013 "О создании электронно-библиотечной системы НГМУ") электронная библиотека переименована в электронно-библиотечную систему.
С 1 октября 2013 г. ЭБС НГМУ введена в опытную эксплуатацию.
ЭБС НГМУ создана в соответствии с Требованиями Министерства образования и науки РФ по обеспеченности обучающихся вузов доступом к электронным научным и образовательным ресурсам. В настоящее время фонд ЭБС НГМУ представлен полнотекстовыми электронными версиями учебных ресурсов, изданных в НГМУ, КрасГМУ, СОГМА. Ведутся работы по включению изданий СибГМУ, ОмГМА, НГТУ.
Возможность работы с каталогом ресурсов ЭБС и поиска в ЭБС по различным критериям обеспечена для всех пользователей. Доступ к полным текстам ресурсов предоставляется только авторизованным пользователям (преподавателям, сотрудникам и всем категориям обучающихся в НГМУ).